在被告申请法院调取证据及费用承担方面，以下特殊情况或例外会影响处理结果：
1、法院依职权主动调取证据：根据相关法律规定，人民法院认为审理案件需要的证据，应当主动调查收集。例如，涉及国家利益、社会公共利益的案件，或依职权追加当事人、中止/终结诉讼、回避等程序事项，法院会主动调取。此时，调取证据的费用由法院从司法经费中支出，无需被告承担，这与被告申请调取证据的费用承担规则不同。
2、双方协商分担费用：部分民事案件中，双方当事人可能就调取证据的费用承担达成一致。比如，对双方均有利的关键证据，双方可约定共同承担调取费用。这种情况下，费用承担将按协商结果执行，改变原规则。
3、被告经济困难的费用减免：若被告经济困难，无力预交调取证据费用，且申请调取的证据对案件事实认定至关重要，可向法院申请缓交、减交或免交费用。法院会审查其经济状况和案件具体情况，符合条件的会批准，从而影响费用承担。
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关于被告能否申请法院调取证据及费用承担问题，被告在诉讼中有权申请法院调取证据，调取费用通常由申请方即被告承担。
若被告因客观原因无法自行收集证据，且该证据与案件待证事实相关联，可向法院申请调取。例如，需调取国家有关部门保存的档案材料，或涉及国家秘密、商业秘密、个人隐私的证据等。
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被告申请法院调取证据时，需注意以下法律风险：
1、申请被驳回风险：若申请调取的证据与案件待证事实无关联，或被告是因自身原因而非客观障碍无法自行收集证据，法院可能驳回申请。例如，仅为拖延诉讼，申请调取与争议焦点无关的企业日常经营流水，很可能被驳回，导致无法获得证据，影响案件辩护。
2、费用承担超预期风险：一般情况下，申请调取证据的费用由申请方预交。但如果调取过程中产生超出预期的高额费用（如赴外地调取证据产生的高额交通、住宿费等），而被告未提前准备，可能因无力承担导致证据调取中断，影响案件正常进行。

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